هنگامی که یک ویروس آلوده به شبح معروف به آتش سوزی شروع به گسترش از طریق سیستم می کند و منجر به ترور نخست وزیر ژاپن می شود ، سرگرد Motoko Kusanagi و تیم نخبه وی از اپراتورهای ویژه فراخوانده می شوند تا منبع آن را ردیابی کنند.
